Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms