Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpina1cQ00896 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms