Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms