Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samsn1P57725 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms