Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNTAP49354 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms