Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkn1bP46414 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cdkn1bP46414 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms