Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf1P46099 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf1P46099 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms