Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms