Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3P10147 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms