Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NGFRP08138 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms