Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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