Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn4O35054 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn4O35054 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn4O35054 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn4O35054 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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