Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Homer1Q9Z2Y3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer1Q9Z2Y3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Homer1Q9Z2Y3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms