Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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