Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms