Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tspan13Q9D8C2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms