Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt34Q9D646 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms