Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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