Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BccipQ9CWI3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms