Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms