Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC1Q8TDI8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC1Q8TDI8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms