Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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