Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms