Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms