Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNS3Q68CZ2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNS3Q68CZ2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms