Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln3Q61124 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms