Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms