Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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