Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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