Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms