Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EEFSECP57772 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EEFSECP57772 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms