Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LUMP51884 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LUMP51884 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LUMP51884 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LUMP51884 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LUMP51884 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LUMP51884 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms