Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PolP10400 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PolP10400 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PolP10400 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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