Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnmt3cP0DOY1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnmt3cP0DOY1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnmt3cP0DOY1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Dnmt3cP0DOY1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Dnmt3cP0DOY1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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