Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa5P09021 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms