Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOL3O95236 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL3O95236 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL3O95236 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms