Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms