Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms