Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms