Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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