Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms