Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn6Q99PL6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms