Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VRK1Q99986 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VRK1Q99986 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VRK1Q99986 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VRK1Q99986 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VRK1Q99986 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VRK1Q99986 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms