Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85AQ96PX6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms