Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP47Q96K76 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms