Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Smg8Q8VE18 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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