Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lin28aQ8K3Y3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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