Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp43Q8BUM9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp43Q8BUM9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms