Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5bQ80Y84 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm5bQ80Y84 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms