Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dsg1bQ7TSF1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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